PROS – Research Center on Software Production Methods

GISPRO: Genomic Information Systems Production – Deciphering the Life Language using the Information Systems Engineering

En un contexto científico en el que el estudio de problemas asociados a la Ciencia de los Datos (Data Science) y a la gestión de grandes volúmenes de datos (Big Data) están en continua expansión, cómo abordar de forma efectiva, eficiente e innovadora la gestión, explotación y mantenimiento de Sistemas de Información (SI) complejos constituye un problema de enorme interés.
Sí existe un dominio ejemplar para tratar esos problemas de gestión, explotación y mantenimiento de datos voluminosos, heterogéneos, complejos en su interpretación y en contínua expansión favorecida por los avances tecnológicos, es el del diseño y desarrollo de Sistemas de Información Genómicos (SIG) que i) posibiliten la gestión efectiva y eficiente de los datos asociados al genoma humano, ii) permitan hacer real el desafío de avanzar sin descanso en conseguir descifrar el lenguaje de la vida y iii) puedan ser el soporte de plataformas software que materialicen el conocimiento desarrollado en el ámbito de una medicina genómica avanzada de precisión como dominio de aplicación de una relevancia social incontestable.
Para alcanzar esos objetivos es necesario disponer de un soporte sólido en el dominio de la Ingeniería de Sistemas de Información y el Modelado Conceptual. Nuestro Centro de Investigación en Métodos de Producción de Software (PROS) tiene una amplia experiencia en ese dominio, y capacidad para materializar el proyecto GISPRO (Genomic Information Systems Production – Deciphering the Life Language using the Information Systems Engineering). GISPRO se nutrirá de los resultados de otros proyectos como: ORCA (PROMETEO/2009/015) “Métodos de desarrollo ORientados a la CAlidad de las tecnologías de la información”, IDEO (PROMETEOII/2014/ 039) “Servicios Innovadores para Empresas Digitales con ORCA” y DataME (TIN2016-80811-P) “Un método de producción de software dirigido por modelos para el desarrollo de aplicaciones Big Data”. La meta principal del proyecto GISPRO es utilizar los avances tecnológicos como fuente de innovación, para ser explotada de manera inteligente y hacer frente a los ambiciosos retos de la sociedad, concretamente: descifrar el lenguaje de la vida.
Durante más de dos décadas hemos investigado, de manera teórica y práctica, los beneficios que el uso de las técnicas más avanzadas en modelado conceptual aportan al correcto desarrollo de Sistemas de Información. Durante este tiempo nuestros resultados han abarcado, entre otros, el diseño de lenguajes de especificación formales ejecutables, métodos de producción automática de software basados en modelos conceptuales, técnicas de modelado de requisitos y metas (objetivos), modelado de procesos de negocio, diversas transformaciones entre modelos conceptuales para soportar arquitecturas MDA (“Model-driven Architecture”) y varias plataformas software, siempre en ambientes de desarrollo dirigido por modelos (MDD). Un conjunto extenso de conocimientos que hemos utilizado en diversos ámbitos de aplicación práctica, especialmente orientado al diseño e implementación de sistemas organizacionales. Dicha aplicación se ha realizado siempre combinando una perspectiva teórica robusta, desde el punto de vista metodológico, y una perspectiva práctica que materialice los resultados con una visión de producto final.
Por tanto, con la intención de ir un paso más allá en este trayecto científico, el proyecto GISPRO va a centrarse en el diseño y desarrollo de Sistemas de Información, desde una perspectiva de producción según la figura 1 (conceptos que se verán posteriormente en los objetivos y plan de trabajo), para un dominio especialmente complejo, atractivo y relevante para la sociedad, tanto a nivel autonómico como a escala mundial: el entendimiento del genoma, y el descifrado del lenguaje de la vida que dicho entendimiento conlleva.
Como planteamiento transversal y para hacer frente a la demanda de la investigación sanitaria del futuro de una forma rigurosa el proyecto contempla, desde sus inicios y en todas sus fases de desarrollo, la incorporación de la perspectiva de género. Esta incorporación es necesaria ya que en el campo de la salud se está intentando promover cada vez más el estudio de la dimensión de género, considerando la segregación por géneros y otras variables sociales, al haberse comprobado que tradicionalmente la investigación en salud no la ha contemplado con la rigurosidad requerida derivando en aproximaciones parciales y estereotipadas, así como vacíos de conocimiento que se han trasladado a la práctica sanitaria actual. Esta variable es un tema donde queda mucho por investigar y que será de gran interés para la sociedad. Por tanto, la estrategia del proyecto es proporcionar capacidad a los Sistemas de Información del ámbito genómico para gestionar variables de género tan importantes como (por ejemplo) las del sexo (hombre y mujer), la clase social, la edad, la etnia, para su posterior uso en investigación genética/médica.
Desde la perspectiva metodológica del proyecto, si hay algún ejemplo paradigmático de entorno complejo para la gestión de datos, ese es -como se señalaba anteriormente- el entorno genómico. Existe además un ámbito de aplicación especialmente significativo, que es el de la Medicina de Precisión (también denominada Medicina Personalizada), que aspira a revolucionar la forma de entender y materializar la asistencia sanitaria que estamos acostumbrados a ver. Este ámbito de aplicación lo consideramos especialmente relevante para el desarrollo del proyecto desde un punto de vista estratégico, y por ello constituirá el caso de estudio que permitirá validar la transferencia correcta de los resultados de I+D del proyecto GISPRO.

Figura 1. Enfoque global del proyecto GISPRO

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Main Researcher:
Óscar Pastor López

Period: 2018 – 2020

Reference:
PROMETEO/2018/176

Funding Organization:
Generalitat Valenciana ( Programa PROMETEO para grupos de investigación de excelencia)
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